Z graczami walczy się na polach treningowych i w walkach o coś oraz w turniejach na stadionie. Na egzaminach walczy się w Akademi Ninja o rangę Genina, w Lesie Śmierci podczas egzaminu na Chuunina i na stadionie. Można także walczyć ze zwierzętami w walkach o coś.
Zasady walki:

1. Post 1 walczącego
2. Post 2 walczącego
3. Podsumowanie rundy przez sędziego (o ile jest wyraźna różnica w atrybutach walczących (STR, AGI, INT) lub jakas nieścisłośc)

Oznacza to, że przy walkach musi być obecny sędzia.
Sędzia przerywa walkę, gdy jeden z walczących ma mniej niż 11 HP i ogłasza zwycięstwo drugiego.

Definicje:
HP (Heal Points) to punkty życia, jeśli nie masz żadnego jesteś martwy.
Chakra jest to energia potrzebna do używania jutsu.
Int (Intelligence) to inteligencja podnosząca siłę twoich jutsu (twoje jutsu zabierają o 0,5 HP więcej/punkt)
Agi (Agility) to zręczność podnosząca twoją szybkość ataku (przez co pośrednio Twoją szansę trafienia w przeciwnika), a także możliwość zrobienia uniku
Str (Strong) to siła zwiększająca obrażenia w walce broniami, nie zwiększa obrażeń jutsu
Jeżeli masz więcej Str niż przeciwnik Agi to za każdy punkt więcej twojej siły zabierasz 1 HP więcej.
Jeśli masz Str na równi z Agi przeciwnika, przeciwnik traci 1HP.
W przypadku, gdy masz mniej Str niż przeciwnik Agi nie trafiasz.

Jeżeli osoba przyjmująca cios ma wiecej AGI niż osoba atakująca, moze zrobic unik, a jeżeli AGI jest równe lub atakujący ma więcej AGI, atakowany nie może zrobić uniku, chyba, że ma Sharingan lub Byakugan.

Aby zabić przeciwnika trzeba go dobić lub użyć na nim śmiercionośnego ataku. Po śmiercionośnym ataku, gracz, który nim oberwał ma jeszcze jednego posta, a następnie ginie, ale śmiercionośne ataki są zakazane i nie można ich używać należąc do dobrej wioski, bo po trzech udanych lub 20 nieudanych atakach śmiercionośnych zostaje się wygnanym z dobrej wioski. Oprócz tego po 5 wioski.